После отклонения императором инициатив Миклухо-Маклая судьба папуасов была предрешена. Остров разделили между собой голландцы, англичане и немцы. Причем последние пробрались на Новую Гвинею под прикрытием доброй славы русского путешественника. Доверенное лицо Германии Отто Финш выдал себя за брата Миклухо-Маклая, скупив под этой маркой плантации и угольную базу. Ослабленное здоровье ученого пошатнули эти новости, и на 41 году жизни он скончался. К 1906 году на остров пришла Австралия, выдавив британцев с англичанами.

Во Вторую мировую Новую Гвинею захватили японцы, а по окончании войны претензии на голландскую территорию влияния выдвинула Индонезия. Австралийцы с голландцами решили создать на острове государство, пообещав его гражданам в перспективе независимость. Однако, как только в 1961-м там завершились выборы и сформировался парламент, Индонезия ввела на часть территории войска. При этом папуасы изгонялись, а их место занимали жители Явы. В ходе той операции погибли до 300 тысяч аборигенов Новой Гвинеи. Признание независимости Австралией в 1975 году охватило только восточную часть острова. Но и это не принесло мир папуасам. Земли бесконечно делили между собой сотни племен, не ведающих о правовых нормах цивилизованной жизни. В конце 20 века там разгорелась очередная кровавая бойня, и сегодня ситуация далека от мирного финала.